全基因组甲基化测序

DNA甲基化是在甲基转移酶的催化下，DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基，形成5-甲基胞嘧啶，这常见于基因的5'-CG-3'序列。DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息，在基因表达调控、遗传印记、染色质重塑、细菌宿主防御、胚胎发育以及人类癌症发生等方面中起着重要的作用；获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据，对表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。

全基因组DNA甲基化测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）是采用重亚硫酸盐处理DNA使其未甲基化修饰的胞嘧啶C转化为尿嘧啶U，通过对处理后的DNA结合Illumina高通量测序平台进行全基因组重测序，并与参考基因组进行比对，在全基因组水平上实现单碱基分辨率，精确评估单个 C 碱基的甲基化水平，进而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。WGBS被广泛应用于人类疾病与动植物研究中，如细胞分化、组织发育等基础机制研究，以及动植物育种、人类健康与疾病治疗等研究领域。

技术流程

数据分析

标准分析

• 原始数据质控

• 比对到参考基因组

• 甲基化位点识别

• 甲基化水平分布趋势：CpG、CHG、CHH甲基化分布比例；CHG/CHH甲基化C附近9bp的序列分析；染色体水平甲基化密度分布；全基因组甲基化图谱；不同基因组区域/基因原件甲基化分布

• 多样本甲基化差异分析：聚类分析；GO分析；KEGG分析

高级分析

• 差异表达基因的甲基化水平

• 差异表达转座子的甲基化水平

• 甲基化修饰与表达调控关系

• 甲基化基因和非甲基化基因的表达分析

样本要求

技术参数

飞凡检测质检报告流程：

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  1、 提供产品资料

• 2、 工程师根据您的产品推荐合适检测项目，并给出报价

• 3、 确认报价没有问题，然后把样品送到我们实验室

• 4、 支付检测费用，安排检测

• 5、检测完成，出具检测报告，邮寄给客户

• 咨询热线：18018131362

• 关于飞凡

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