全长16S/18S/ITS扩增子测序

目前，16S/18S/ITS rRNA是微生物分类鉴定和系统发育的指标。原核微生物的16S rRNA基因长度约为1500 bp，包含10个保守区和9个高变区（V1-V9），同时具有高度的保守性和特异性，保守区可反映菌属间的亲缘关系，可变区体现菌属之间的差异。真核微生物18S rRNA基因长度约为1500~2000 bp，序列中也既有保守区和可变区，由于进化速率比较保守，适用于种级以上的分类鉴定。真核微生物ITS长度约为500 bp，在种内不同菌株之间高度保守，而在菌种间存在较大的变化，表现出极大的序列多态性，被广泛应用于生物种间系统发育和研究。

既往的16S/18S/ITS rRNA扩增子测序针对其序列的单个或连续的两个或三个可变区设计引物扩增再测序分析；而现在基于三代PacBio SMRT测序平台，我们使用27F/1492R的引物，平均读长10~18 K，可轻松覆盖16S/18S/ITS rRNA全长序列，突破二代测序读长短的局限性，实现精确到“种”的分类鉴定，可在多个领域应用如物种进化、物种丰度、环境与生态、医学领域等，研究表皮微生物的关系、人体肠道微生物与疾病。

技术流程

数据分析

我们使用Circular Consensus Sequencing（CCS）的算法来矫正测序产生的错误，提高测序的准确性。通过去除barcode以及长度小于150 bp以及模棱两可的序列，通过99%的相似性产生OTU和比对数据库最后进行分类。

样本要求

技术参数

飞凡检测质检报告流程：

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  1、 提供产品资料

• 2、 工程师根据您的产品推荐合适检测项目，并给出报价

• 3、 确认报价没有问题，然后把样品送到我们实验室

• 4、 支付检测费用，安排检测

• 5、检测完成，出具检测报告，邮寄给客户

• 咨询热线：18018131362

• 关于飞凡

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飞凡检测致力于打造国内专业的第三方检测服务公司，不断优化整合市场检测资源，飞凡检测与多家科研院所，如上海同济大学，苏州大学，SGS，TUV，以及国内众多知名的检测公司进行深度合作，共同为国内制造业服务，为中国的制造业开拓海外市场保驾护航，为我们日常生活的健康安全树立标杆；公司目前工程师百余人，95%以上是本科以上学历；我们合作的实验室通过CNAS，CMA（EZ），所出具的任何一张报告都有CNAS，CMA资质，确保出具的每份报告都具有权威的法律效力。

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• 为什么选择我们

• 市场需求和成熟的模式给了我们成功的保证

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