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简化甲基化测序

浏览次数:160|来源:飞凡检测 | 2022-02-21 11:06:08

简化甲基化测序(RRBS, Reduced Representation Bisulfite Sequencing)是一种准确、快速、高效、经济的DNA甲基化研究方法,通过利用限制性内切酶对基因组进行酶切,富集启动子及CpG岛区域,并进行Bisulfite处理及富集建库,结合Illumina高通量平台测序,是一种高性价比测序方法。

RRBS 作为一种关注CpG-rich 区域的甲基化研究方法,同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率,能够避免过多的数据浪费,更有针对性的研究覆盖区域的甲基化状态,使得大规模样本研究成为可能,被广泛应用于大样本单碱基分辨率甲基化差异分析和疾病分子标记开发。

技术流程

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数据分析

      标准分析

  • 原始数据质控

  • 比对到参考基因组

  • 甲基化位点识别

  • Promoter和CpG岛覆盖分析

  • Promoter和CGI区的甲基化分析

  • 多样本甲基化差异分析:聚类分析;GO分析;KEGG分析

      高级分析

  • 差异表达基因启动子区的甲基化水平分布

  • 甲基化修饰与表达调控关系 

样本要求

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技术参数

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