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动植物基因组测序

浏览次数:26|来源:飞凡检测 | 2021-10-29 16:23:06

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基因组调研图研究是对于没有基因组参考序列的物种,基于小片段文库的低深度测序数据,可以有效地评估基因组大小、GC含量、杂合度高低以及重复序列含量等信息,是全面了解某一物种基因组特征的有效方法;此外,通过基因组调研分析也可对基因组进行初步组装。
项目周期:
动植物基因组Survey开发时间为6周;3个样品或以上,以及基因组大于1G为2个月。
开发时间以样品到位并检测合格为前提;收到样品后,需要对样品进行检测,最终样品的量和纯度,以公司的检测结果为准。
测序平台及策略:
整体测序深度不低于30倍覆盖度;
预测基因组大小,评估基因组GC含量,评估基因组杂合率;
确定精细图梯度文库构建具体策略
技术路线:

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分析内容:
1.标准信息分析
数据基本处理,去低质量和接头序列;K-mer 分析以及基因组大小估计;杂合率估计;精细图建库方案评估;
2.高级信息分析(只针对纯调研图项目)

初步组装;GC-Depth 分布分析,判断测序偏好性;SSR标记鉴定;样品间SNP鉴定(多样本情况下)

飞凡检测质检报告流程:


1、 提供产品资料

2、 工程师根据您的产品推荐合适检测项目,并给出报价

3、 确认报价没有问题,然把样品送到我们实验室

4、 支付检测费用,安排检测

5、检测完成,出具检测报告,邮寄给客户

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关于飞凡


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