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Small RNA 测序

浏览次数:19|来源:飞凡检测 | 2021-11-15 17:09:35

什么是Small RNA?


Small RNA 是一类重要的体内调节分子,长度在 18-30nt,主要包括 miRNA、 siRNA 和 piRNA。在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Small RNA 测序采用 Illumina 测序平台,研究某一物种特定组织在特定状态下的已知 Small RNA,也可发现新的物种或组织特异Small RNA并预测其靶基因,为研究 Small RNA 的功能及此物种的基因调控机制提供了有力工具,已广泛应用于动植物的研究和医学领域。

飞凡检测关于Small RNA测序方案设计


Small RNA 实验设计思路为差异比较,常见的类型为实验组与对照组(case VS control),进行两两比较;若考虑时空因素,如按照不同生长发育阶段或者疾病发生发展整个过程进行比较,即进行多重比较分析,然后对差异的miRNA 进行靶基因预测和富集分析。一组样品建议至少 6 个生物学重复。


Small RNA测序样本要求

动物RNA测序样品、动物细胞样本RNA测序样品、动物血液样品、植物RNA测序样品都有具体的样品要求。

藻类样品:收集新鲜藻类样本(无培养基残留),大于200mg。12000rpm离心,弃上清(无培养基残留),取样后液氮快速冷冻,-80℃冻存,干冰运输,不建议使用RNAlater。


Small RNA分析测序项目

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