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细菌全基因组De Novo三代测序
细菌是生物的主要类群之一,也是所有生物中数量最多的一类,广泛分布于土壤和水中,或与其他生物共生。据估计,人体内及表皮上的细菌细胞总数约是人体细胞总数的十倍,与人类生活息息相关,影响着人类健康。因此明确细菌基因序列是深入研究其表达调控、毒性、代谢等生物功能的基础。
美国太平洋生物科学公司(PacBio)推出的Single Molecule Real-Time sequencing(SMRT),即单分子实时测序,实现了对单个DNA分子的实时监控测序。其具有长读长、无GC偏向和无PCR扩增等优势,有效解决了传统二代测序技术的组装难题,大幅度提升了基因组组装的各项指标,能够克服细菌基因组GC异常、高度重复的问题,得到细菌完成图,No Gap,No N碱基。
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我们的生物信息团队提供基因组的组装,优化以及完整的基因注释
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