三代宏基因组测序

宏基因组学（Metagenomics）又叫元基因组学、微生物环境基因组学。是直接从特定环境样本中提取全部微生物的总DNA（也称宏基因组，metagenome），对其进行高通量测序、序列组装和基因注释，获得环境微生物基因组信息总和，以研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能以及代谢通路等。摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制，在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘更多基因资源方面具有很大优势，其应用渗透到各个领域, 包括医学、农业、畜牧、环境等。

近年来，新一代测序技术（Next Generation Sequencing）的发展使研究宏基因组的方法也已经发生了变化，人们可以较快速准确的得到大量生物数据和丰富的微生物研究信息，从而成为研究微生物多样性和群落特征的重要手段。伴随着PacBio测序平台的问世，宏基因组学的研究又增加了一个有力的研究途径，其长读长、无GC偏向和无PCR扩增等优势可以获得更多信息，避免二代测序技术在面对复杂微生物群落时的瓶颈：因读长短、不能跨越重复序列、高GC含量序列等，无法真正揭示菌群的复杂情况。

利用三代实时单分子测序PacBio SMRT技术，我们可以获得更多基因组信息，更准确的物种分类，更多的物种鉴定，较为全面地刻画微生物群落各方面的特性，可最真实的还原环境中微生物群落信息，从而深入探讨它们对于整个生态系统的重要意义。

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