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全长转录组测序

浏览次数:31|来源:飞凡检测 | 2021-11-16 09:54:19

全长转录组测序

基于PacBio三代测序平台的全长转录组测序,可直接获取mRNA全长序列,更为准确地解读mRNA结构信息,重点关注基因的可变剪切、融合基因等。


测序应用领域

◇ 获得基因组未知物种的基因集,用于基因功能研究

◇ 基因结构差异分析

◇ 发现新转录本

◇ 分子机制研究

◇ 基因表达调控研究


飞凡检测测序的优势:

◇ 完善的样品提取检测方案,保障 mRNA 的完整性;

◇飞凡检测拥有 PacBio Sequel 及 PacBio RSII 单分子测序平台,提供测序服务;

◇ 深度测序推荐,挖掘低丰度基因信息;

◇ 分析团队,项目经验丰富,提供个性化分析内容。


技术路线:


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飞凡检测关于全长转录组测序常见问题




  1. 1. PacBio测序平台的技术原理?                                    

    利用 PacBio RS II/Sequel 进行全长转录组测序,平台包含 16 个测序模块(SMRT cell),每个 SMRT cell 包含 15 万/100万个测序单元(零模波导孔,ZMWs)。需要将 mRNA 进行反转录并进行环化处理,形成 CCS,每个 ZMW(零模波导孔)将容纳 1 个 CCS 分子。由于全长转录组测序对 mRNA 不进行打断,直接进行上机测序,而每个 CCS 的片段长度不同,较小的 CCS 会先落入 ZMWs 中,而导致长片段很难测到。因此,在文库构建时,需要将 mRNA 根据长度分成不同的段,分别构建文库和测序。                                    

  2.  2. PacBio测序平台测序方案有什么推荐?                                    

    对样本进行分段处理,构建不同片段长度的文库,我们推荐每个样本构建3-6个文库。 建议8-15G subreads。                                    

  3. 3. 全长转录组测序分析内容包括哪些?                                    

    分析内容包括:转录本覆盖度计算、转录本功能注释、转录本GO 分类注释、转录本 eggNOG分类注释、转录本KEGG分类注释、ORF分析、可变剪接分析等。   


飞凡检测质检报告流程:


1、 提供产品资料

2、 工程师根据您的产品推荐合适检测项目,并给出报价

3、 确认报价没有问题,然后把样品送到我们实验室

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5、检测完成,出具检测报告,邮寄给客户

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关于飞凡


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飞凡检测致力于打造国内专业的第三方检测服务公司,不断优化整合市场检测资源,飞凡检测与多家科研院所,如上海同济大学,苏州大学,SGS,TUV,以及国内众多知名的检测公司进行深度合作,共同为国内制造业服务,为中国的制造业开拓海外市场保驾护航,为我们日常生活的健康安全树立标杆;公司目前工程师百余人,95%以上是本科以上学历;我们合作的实验室通过CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一张报告都有CNAS,CMA资质,确保出具的每份报告都具有权威的法律效力。


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